生態河道治理是城市河道污染治理必不可少的，但傳統的工程修復往往帶有許多認為干涉影響。在進行河道治理過程中又影響了河道的其他功能，所以總體效益很小。通過符合生態學方面的治理措施，減少認為干涉，建立河流的生態系統，完善其生態功能，使其具有自我修復自我凈化的功能，最終成為親水宜人的環境生態景觀，滿足城市社會經濟生活發展需要，建設和諧的生態家園。
生態河道治理主要分為以下三步：
一、 修復河岸植被。在干支流各明渠段，恢復河岸帶植被，充分發揮河岸帶植被的緩沖帶功能和護坡效應，盡可能恢復和重建退化的河岸帶生態系統，保護和提高生物多樣性。
二、 修復河道形態。重新營造出接近自然的流路和有著不同流速帶的水流，即修復河流淺灘和深塘，有利于形成水的紊流，造就水體流動多樣性，以有利于生物的多樣性。
三、 修復河床斷面。主要是改造水泥和混凝土硬化河床，修復河床的多孔質化，同時改造護岸，建設生態河堤，為水生生物重建生息地環境。改變現有僵硬、沉悶、單調的灰色混凝土護岸為草皮或地衣植被覆蓋的柔性護坡。部分河段可拆除以前在河床上鋪設的硬質材料，修復河床自然泥沙狀態；部分河段釆用復式斷面，可以種草、爬藤類植物或栽植低矮喬木，平時作為河道立體綠化的一部分；慎重考慮河道覆蓋與侵占河道；改造原有河道護坡和護岸結構，修建生態型護岸。
