現在大多數飲料制造商都對殺菌消毒工藝情有獨鐘，越來越多的偏重于紫外線殺菌器保證產品的安全性。微生物受紫外線光照射后，其蛋白質和核酸吸收了紫外光譜能量，會導致蛋白質變性，引起微生物死亡。
紫外線殺菌設備簡單，不需要配套設備，而且成本低，操作管理方便，使用比較廣泛。微生物受紫外線光照射后，其蛋白質和核酸吸收了紫外光譜能量，會導致蛋白質變性，引起微生物死亡。
紫外線殺菌方式一般適合在以下幾類飲料灌裝的瓶蓋中使用：
1、碳酸飲料
碳酸飲料中含有CO2，呈酸性，能抑制微生物的生長，因此碳酸飲料的瓶蓋采用紫外線消毒既能滿足需求。該方法在生產時，批量包裝的新瓶蓋倒入輸蓋機的儲料倉，瓶蓋在輸蓋機的儲料倉內或輸送帶上接受紫外線的照射消毒；還可以在擰蓋機下蓋滑道上設置紫外線殺菌燈，讓瓶蓋的內表面接受紫外線的照射殺菌，殺菌后直接輸往擰蓋機。
2、礦泉水飲料
國家對礦泉水的生產制定了比較嚴格的規定，其中對礦泉水的菌落總數、霉菌計數和大腸桿菌都嚴格限制為零。無論是否經過過濾殺菌處理的礦泉水，其總細菌數、霉菌計數和大腸桿菌數都必須符合國家標準。由于礦泉水中只含無機鹽，不含微生物營養源，缺少工微生物生產發育的營養成分，因而對其瓶蓋也可以采用紫外線殺菌。
3、高溫灌裝的茶飲料、果汁飲料
茶飲料和果汁飲料中存在著各種微生物（細菌、霉菌和酵母等），飲料的殺菌就是要殺滅這些微生物。目前一般都采用高溫短時殺菌法，也稱瞬時殺菌法。高溫灌裝是讓經過瞬時殺菌后的飲料冷卻在85℃~92℃之間的一個溫度區的耐熱瓶蓋，灌裝方式采用滿瓶灌裝，灌裝壓蓋（或擰蓋）后增加倒瓶裝置：瓶身傾倒90°~180°，利用飲料自身的高溫對瓶蓋內部進行殺菌處理。因此瓶蓋的前期處理也可以采用紫外線殺菌消毒。
