科學技術的迅速發展和人口的急劇增長等，直接干擾了水的自然環境。為了尋求社會的高速發展，甚至以犧牲水環境為代價，致使在經濟發展的同時，也埋下了水污染的隱患，經人類和人們的生活帶來了負面影響，甚至威脅到了人類的生存。
水污染，根據污染物的不同，影響著人們生活的方方面面。
人體內60%—70%以上都是水，就是說，人是水做的。它同陽光、空氣并稱為生命三要素，是人類生存最基本的物質。
1、有毒物質的污染
有毒物質包括兩大類：一類是指汞、鎘、鋁、銅、鉛、鋅等重金屬；另一類則是有機氯、有機磷、多氯聯苯、芳香族氨基化合物等化工產品。許多酶依賴蛋白質和金屬離子的絡合作用才能發揮其作用，因而要求某些微量元素（例如錳、硼、鋅、銅、鉬、鈷等），然而，不合乎需要的金屬，例如汞和鉛，甚至必不可少的微量元素的量過多，如鋅和銅等，都能破壞這種蛋白質和金屬離子的平衡，因而削弱或者終止某些蛋白質的活性。
例如汞和鉛與中樞神經系統的某些酶類結合的趨勢十分強烈，因而容易引起神經錯亂，如瘋病、精神呆滯、昏迷以至死亡。此外，汞和一種與遺傳物質DNA一起發生作用的蛋白質形成專一性的結合，這就是汞中毒常引起嚴重的先天性缺陷的原因。
重金屬原子結合到蛋白質上后，就不能被排泄掉，并逐漸從低劑量累積到較高濃度，從而造成危害，這些重金屬與蛋白質結合不但可導致中毒，而且能引起生物累積。
經過調查發現，金屬形式的汞并不很毒，大多數汞能通過消化道而不被吸收。然而水體沉積物中的細菌吸收了汞，使汞發生化學反應，反應中汞和甲基團結合產生了甲基汞（Hg-CH3）的有機化合物，它和汞本身不同，甲基汞的吸收率幾乎等于100%，其毒性幾乎比金屬汞大100倍，而且不易排泄掉。
2、水體富營養化
水體富營養化是一種有機污染類型，由于過多的氮、磷等營養物質進入天然水體而惡化水質。施入農田的化肥，一般情況下約有一半氮肥未被利用，流入地下水或池塘湖泊，大量生活污水也常使水體過肥。
過多的營養物質促使水域中的浮游植物，如藍藻、硅藻以及水草的大量繁殖，有時整個水面被藻類覆蓋而形成“水花”，藻類死亡后沉積于水底，微生物分解消耗大量溶解氧，導致魚類因缺氧而大批死亡。水體富營養化會加速湖泊的衰退，使之向沼澤化發展。
海洋近岸海區，發生富營養化現象，使腰鞭毛藻類（如裸溝藻和夜光蟲等）等大量繁殖、密集在一起，使海水呈粉紅色或紅褐色，稱為赤潮，對漁業危害極大。
