水資源保護和水體污染控制要從兩方面著手：一方面制訂水體的環境質量標準，保證水體質量和水域使用目的；另一方面要制訂污水排放標準，對必須排放的工業廢水和生活污水進行必要而適當的處理。對水質要求最基本的是《地表水環境質量標準》，由國家環保總局發布GB3838-2002。GB表示國標，3838表示標準號，2002表示發布年代。
中國水環境污染嚴重，主要超標項目是有機物和氨氮，這與中國城鎮生活污水沒得到有效處理有關。
水中有機物含量高時會直接影響水的臭與味，讓人厭惡。人們對水中有機物的危害的關注，從有毒有害有機物到三致（致畸、致突變、致癌）物質又發展到內分泌干擾物（類激素）。一般水中有機物是微量的，甚至是痕量的，要從人類健康上反映，需要有個長期的過程（20～30年）。我們能夠測出并研究其對人類健康影響的水中有機物才數百種，隨著分析測定方法與分析儀器的發展、提高，能被測出的有機物將越來越多，而這些有機物對人的危害的全面研究也需時日，所以當我們尚未認識它們的危害前，對其總量（也即宏觀上）進行一定的控制，對中國人民未來健康是必要的。
水污染防治辦法
根據中國水污染防治法（1996年修訂）第20條規定：“省級以上人民政府可以依法劃定生活飲用水地表水源保護區，生活飲用水地表水源保護區分為一級保護區和其他等級保護區。在生活飲用水地表水源取水口附近可以劃定一定的水域和陸域為一級保護區。在生活飲用水地表水源一級保護區外，可以劃定一定的水域和陸域為其他等級保護區。……對生活飲用水水源保護的具體辦法由國務院規定”。
2000年3月20日國務院令頒布了水污染防治法實施細則，其第21條明確規定：“生活飲用水地表水源一級保護區內的水質適用國家'地表水環境質量標準Ⅱ類標準，二級保護區內的水質適用國家Ⅲ類標準。”Ⅱ類標準中關于有機物綜合性指標有CODCr，BOD5與高錳酸鹽指數（即耗氧量CODMn），相應的限值是15 mg/L，3 mg/L與4 mg/L。
新的衛生規范中“水源選擇及水質要求”5.1.7規定水源水中耗氧量不應超過4 mg/L，五日生化需氧量不應超過3 mg/L。規范5.3中明確：水質不符合5.1節和附錄A中規定時，不宜作為生活飲用水水質，若限于條件需加以利用時，應采用相應的凈化工藝進行處理，處理后的水應符合規定并取得衛生行政部門的標準。作為集中供水水源水質要求，必須是Ⅱ類標準， 當水源水質達不到要求時，就應加強處理使其達到水質標準而不是牽就現狀，降低標準。
